然而很快計劃就遇到了麻煩，聯(lián)邦政府在2009年年底宣布將第一階段到2015年的500MW裝機目標(PV和CSP各占一半)縮減為400MW。而后，政府又在2010年5月份收回了2.2億澳元的預算，并表示可能無法進行該計劃的第二階段，但具體決定會在第一階段完成后宣布。
“太陽能旗艦計劃”的沉沒證明了澳大利亞聯(lián)邦政府無法正確設計和管理太陽能獎勵方案。在過去的幾年中，澳大利亞太陽能光伏行業(yè)已經(jīng)陷入了一個繁榮到蕭條的周期循環(huán)——激勵方案出臺，經(jīng)過迅速發(fā)展，然后快速取消;而后一個新的方案很快出臺，遵循相同的模式。“太陽能旗艦計劃”的致命傷在于審批程序太過緩慢以至于項目規(guī)劃無法跟上市場前進的步伐，一些機制太過狹隘，最終導致計劃規(guī)模和預算的削減。自從該計劃公布后，由于光伏組件價格的持續(xù)下降，兩年半多的時間里系統(tǒng)的價格幾乎降低了一半。
此外，澳大利亞的大多數(shù)公用事業(yè)仍不愿接受來自太陽能光伏發(fā)電設施的電力。澳大利亞各地的公用事業(yè)一直緩慢回應太陽能光伏發(fā)電行業(yè)，許多設施安裝后，往往要經(jīng)過幾個月的拖延才能被連接到電網(wǎng)。他們甚至漠視客戶要求太陽能電力連接入網(wǎng)的要求，還將電力零售價格上升的責任歸咎于太陽能電力事業(yè)的補貼，而事實上，更新老化的輸電設施和配電網(wǎng)絡才是成本增加的主要因素。
本來，“太陽能旗艦計劃”的初衷是為澳大利亞大規(guī)模發(fā)展太陽能發(fā)電鋪平道路，現(xiàn)在雖然沒有完成最初計劃的數(shù)字，但是目的已經(jīng)達到了。目前澳大利亞有數(shù)個大規(guī)模多兆瓦級的項目正在建設中，其中有一個項目(西澳大利亞州杰拉爾頓的一個10MW項目)將在2012年第四季度建設完成。聚光太陽能熱發(fā)電方面，今年1月開始建設的一個44MW項目將會在一年后完成建設并投入運營。
總而言之，關于“太陽能旗艦計劃”成敗的定論已經(jīng)無關緊要。從長遠來看，由于混合了積極的經(jīng)濟和政策因素(如可再生能源目標和碳價格機制)，澳大利亞的太陽能光伏發(fā)電的前景依然強勁。
